Crabtree erstellte präzise Planetentafeln, weil die damals verfügbaren nur ungenaue Positionen lieferten. Ab 1636 korrespondierte er mit Jeremiah Horrocks, einem anderen ebenso begeisterten wie begabten Amateurastronomen, der 40 Kilometer entfernt wohnte. Crabtree und Horrocks sagten einen Vorübergang der Venus vor der Sonne für den 24. November 1639 voraus. Beide waren die ersten, die das äußerst seltene Phänomen eines Venustransits beobachtet haben.
Bis heute rätseln Historiker, wie William Crabtree fernab im ländlichen Lancashire eine sehr aktive Gruppe von Astronomen um sich sammeln konnte. Zu diesem Zirkel gehörten auch Charles Towneley, Jeremy Shakerley und William Gascoigne aus Yorkshire. Sie alle kannten sich exzellent in moderner Astronomie aus und waren bestens mit den Werken von Brahe, Kepler, Galilei, Gassendi und anderen vertraut. Doch die Blüte der Astronomie in der Umgebung von Liverpool währte nicht lange. Horrocks starb 1641 im Alter von nur 22 Jahren. William Crabtree wurde nur 34 Jahre alt. Er starb 1644 in Manchester.