Schwarz-Grün sei keine Option, sagte Söder im ARD-Fernsehen. Vielmehr brauche es bei der Bundestagswahl einen echten Richtungswechsel. Der Grünen-Parteitag habe diesbezüglich keine echten Lösungsansätze geboten. Bei der Delegiertenkonferenz wurde Wirtschaftsminister Habeck zum Spitzenkandidaten der Grünen für die Bundestagswahl im Februar gewählt. In seiner Bewerbungsrede hatte sich Habeck unter anderem für eine Reform der Schuldenbremse ausgesprochen. Zugleich warnte er vor einer Rückkehr zur Koalition aus Union und SPD.

Vom ehemaligen Koalitionspartner FDP kam nach der Wahl scharfe Kritik. Generalsekretär Djir-Sarai sagte der Nachrichtenagentur Reuters, Habeck stehe für eine verfehlte Wirtschaftspolitik. Seine "linksgrüne Ideologie" sei "Gift für den Wirtschaftsstandort und eine Bedrohung für Arbeitsplätze und Wohlstand in Deutschland". Die FDP stehe für eine andere Politik.