Er starb am Samstag im Alter von 95 Jahren in München, wie seine Ehefrau der Deutschen Presse-Agentur mitteilte.

Von Dohnányi wurde mit 27 Jahren in Lübeck jüngster deutscher Generalmusikdirektor. Später übernahm er unter anderem die Leitung der Hamburgischen Staatsoper und des NDR Sinfonieorchesters.

Sein Vater war der Widerstandskämpfer Hans von Dohnányi, der im KZ Sachsenhausen hingerichtet wurde.