Er veröffentlichte sein Rücktrittsschreiben an Kommissionspräsidentin von der Leyen auf der Online-Plattform X. Darin heißt es, von der Leyen habe vor einigen Tagen die Regierung in Paris dazu gedrängt, seine Kandidatur für die neue Kommission zurückzuziehen. So habe die CDU-Politikerin Frankreich einen angeblich einflussreicheren Posten angeboten, sollte Breton von der Liste gestrichen werden. Dies sei ein weiteres Zeugnis eines fragwürdigen Agierens der Kommissionspräsidentin. Breton warf ihr zudem vor, ihr Ansinnen zu keinem Zeitpunkt mit ihm persönlich besprochen zu haben. Von der Leyen nahm den Rücktritt inzwischen an, nahm aber keine Stellung zu dem Sachverhalt.

Inzwischen schlug Frankreichs Präsident Macron als Nachfolger von Breton den bisherigen Außenminister des Landes, Sejourne, vor.