Den Angaben zufolge erhielt er 91,3 Prozent der Stimmen. An der Abstimmung hatten nach Informationen der Deutschen Presse-Agentur 197 von insgesamt 208 Parlamentariern der CDU und CSU teilgenommen. Zustimmung kam von den Christsozialen. Deren Vorsitzender Söder nannte Spahn einen "Glücksgriff für die Fraktion". Dieser werde zusammen mit dem neuen CSU-Landesgruppenvorsitzenden Hoffmann dafür sorgen, dass es auch Rückendeckung aus dem Parlament für schwere Zeiten gebe.

In der Sitzung der Unionsfraktion bekräftige Spahn vor seiner Wahl die Abgrenzung zur AfD. Spahn betonte, man nehme den vorgelegten Bericht des Verfassungsschutzes sehr ernst. Er kündigte eine sorgfältige Auswertung an. Die Deutsche Presse-Agentur zitiert Spahn mit den Worten, daraus folge für Union und SPD, dass es keine Empfehlung geben werde, AfD-Politiker zur Ausschussvorsitzenden zu wählen.

Vor seiner Nominierung zum Fraktionschef hatte Spahn sich noch dafür ausgesprochen, mit der AfD im Parlamentsbetrieb so umzugehen wie mit anderen Oppositionsparteien auch. Auf Nachfrage erklärte Spahn, der Bericht des Bundesamts für Verfassungsschutz habe "die Lage nochmal verändert".