Werner war zuletzt als Trainer von Werder Bremen tätig. Der Verein hatte ihn Ende Mai freigestellt. Werner hatte Bremen 2021 noch zu Zweitligazeiten übernommen. Für Werder war er in 128 Pflichtspielen verantwortlich und beendete die abgelaufene Saison auf dem achten Tabellenrang, punktgleich mit Leipzig.