Neu bestimmt werden die Parlamente in 13 Regionen mit Ausnahme der Hauptstadt Prag, die einen Sonderstatus hat. Die Wahlen gelten als wichtiger Stimmungstest für die Parlamentswahl im nächsten Jahr. In einem Drittel der Wahlbezirke werden außerdem die Abgeordneten des Senats neu bestimmt. Das Oberhaus des Parlaments hat ein Mitspracherecht bei der Gesetzgebung und kann Verfassungsänderungen verhindern.

In den am stärksten von Überschwemmungen betroffenen Städten und Gemeinden hatte es Forderungen nach einer Verschiebung der Wahlen gegeben. Die Regierung von Ministerpräsident Fiala lehnte dies mit der Begründung ab, dass eine solche Entscheidung rechtlich anfechtbar wäre.