Der in Miami geborene Thomas gründete 1974 in Cleveland im US-Bundesstaat Ohio zunächst die Band Rocket from the Tombs. Ein Jahr später formierten Thomas und der Musiker Peter Laughner Pere Ubu. Der Bandname ist angelehnt an einer Figur des französischen Schriftstellers Alfred Jarry. 1978 erschien das Debütalbum "The Modern Dance".

Pere Ubu kombinierte experimentelle Rockmusik mit Elementen aus Punk, Musique concrète, Krautrock oder Free Jazz. Die Band bezeichnet ihre Musik als "Avant-Garage", einer Mischung aus Avantgarde und Garage Rock. Pere Ubu befand sich aktuell im Aufnahmeprozess eines neuen Albums, das laut Mitteilung Thomas‘ letztes Werk sein sollte. Das Material soll posthum fertiggestellt und veröffentlicht werden.