In der Begründung für die Medaille heißt es, die Synagoge sei heute ein Ort des Dialogs mit bundesweiter Ausstrahlung. Zum 50. Jahrestag der Reichspogromnacht wurde die Stiftung 1988 in der DDR gegründet, mit dem Ziel, die beim Pogrom in Brand gesetzte und später zerbombte Neue Synagoge wieder aufzubauen und Dokumente zu jüdischen Leben in Berlin zu sammeln.

Verliehen wird die Buber-Rosenzweig-Medaille vom Koordinierungsrat der Gesellschaft für christlich-jüdische Zusammenarbeit. Frühere Preisträger waren unter anderem die ehemalige Bundeskanzlerin Angela Merkel und der Musiker Peter Maffay.